針對RNA酶的一些注意事項
防止RNA酶污染的措施:
1、 所有的玻璃器皿均應在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長時間。
2、 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿沖洗(注意:有機玻璃器具因可被氯仿腐蝕,故不能使用)。
3、 有機玻璃的電泳槽等,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室溫10min,然后用0.1% DEPC水沖洗,晾干。
4、 配制的溶液應盡可能的用0.1% DEPC,在37℃處理12hr以上。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC。不能高壓滅菌的試劑,應當用DEPC處理過的無菌雙蒸水配制,然后經0.22μm濾膜過濾除菌。
5、 操作人員戴一次性口罩、帽子、手套,實驗過程中手套要勤換。
6、 設置RNA操作專用實驗室,所有器械等應為專用。
7、 DEPC能與胺和巰基反應,因而 含Tris和DTT的試劑不能用DEPC處理
8、 加樣原則是DNA最后加,其他試劑按照體積大小從大往小的加。如果是同種引物和探針有多管的話只是DNA不同,那么采取的方法是算出總體積后加在一個管子里面,混合均勻之后再分裝到各個管子里去,這樣可以有效地避免誤差及污染。
9、 普通實驗室容易污染,且污染程度很高,與跑電泳還有質粒制備提取都在同一個房間里有比較大的關系,最容易造成高濃度污染的就是產物的開蓋和質粒的稀釋。因此要格外注意一些。
常用的RNA酶抑制劑:
1、 焦磷酸二乙酯(DEPC):是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環結合使蛋白質變性,從而抑制酶的活性。
2、 異硫氰酸胍:目前被認為是最有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結構使核酸從核蛋白中解離出來,又對RNA酶有強烈的變性作用。
3、 氧釩核糖核苷復合物:由氧化釩離子和核苷形成的復合物,它和RNA酶結合形成過渡態類物質,幾乎能完全抑制RNA酶的活性。
4、 RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑,可以和多種RNA酶結合,使其失活。
5、 其它:SDS、尿素、硅藻土等對RNA酶也有一定抑制作用。因為DEPc不加選擇的修飾蛋白質和RNA,因此在分離和純化RNA過程中不能使用,而且它與一些緩沖液(例如Tri)不能相容在所有RNA實驗中,最關鍵的因素是分離得到全長的RNA。而實驗失敗的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。
附確認RNA溶液中有沒有殘留的RNA酶的方法:
按照樣品濃度,從RNA溶液中吸取兩份1000 ng的RNA加入至0.5 ml的離心管中,并且用pH7.0的Tris緩沖液補充到10 ul的總體積,然后密閉管蓋。把其中一份放入70℃的恒溫水浴中,保溫1 h。另一份放置在-20℃冰箱中保存1 h。取出兩份樣本進行電泳。電泳完成后,比較兩者的電泳條帶。如果兩者的條帶一致或者無明顯差別, 則說明RNA溶液中沒有殘留的RNA酶污染,RNA的質量很好。相反的,如果70℃保溫的樣本有明顯的降解,則說明RNA溶液中有RNA酶污染。


