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影響酶切的幾個主要因素
發(fā)布日期:2022-06-16 09:05:12


影響酶切的幾個主要因素


影響酶切的幾個主要因素:


1. 質粒DNA的質量


1)質粒DNA的質量是決定酶切效率的最最要的因素。通常在克隆時,如果反復優(yōu)化酶切條件后,都不能實現(xiàn)完全酶切,最可能的原因就是質粒DNA的質量有問題。

2)DNA的質量監(jiān)測通常有兩個方法:

首先OD260/OD280比值應該在1.8左右(1.7-1.9),否則意味著DNA樣品中存在大量的蛋白質或RNA污染。

其次,瓊脂糖電泳分析時應主要以超螺旋條帶為主。

最多不超過三條帶(分別為超螺旋DNA,線性化DNA和環(huán)狀DNA)。否則意味質粒DNA的質量不高,應該重新制備。

2.限制性內切酶的活性


1)限制性內切酶一般需要低溫保存,而且反復的升降溫過程對酶活性的損害很明顯。因而為了確保在有效期內的限制性內切酶不會失活,限制性內切酶的日常保存和使用應當很小心。


2)建議購買具有保溫功能的凍存盒保存限制性內切酶(-20度),而且取用限制性內切酶時,也應該使用具有保溫功能的凍存盒,盡量防止酶的溫度反復出現(xiàn)大的波動。

3.限制性內切酶的用量


1)限制性內切酶的單位定義通常為:在合適的溫度下,完全消化1ugDNA底物所需的酶量定義為一個單位。

2)在這個單位定義中,有幾個不確定因素:

首先是底物,不同的酶單位定義是選擇的底物可能不同(常用的幾個底物DNA包括:Lambda DNA ,AD2 DNA 和一些質粒DNA);

第二個不確定因素是限制性內切酶在底物DNA上的酶切位點的個數。

由于單位定義中要求完全消化,因而底物上某個酶的酶切位點的個數的多少,就直接影響了該酶的單位定義。

3)因而,在進行酶切時,用1ul酶(一般10IU/ul)消化1ugDNA的通常做法是很不科學的,這也導致在實際工作中,大家要進行多次預實驗才能確定最合適酶切條件。




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